Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gnb1P62874 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms