Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rps29P62274 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms