Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2d1P61080 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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