Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms