Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms