Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5bP56480 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5bP56480 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5bP56480 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5bP56480 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5bP56480 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5bP56480 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5bP56480 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5bP56480 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5bP56480 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms