Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms