Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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