Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms