Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik2P39087 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik2P39087 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms