Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TtlP38585 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TtlP38585 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TtlP38585 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms