Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp3P28862 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms