Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms