Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpl3P27659 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpl3P27659 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpl3P27659 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpl3P27659 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpl3P27659 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl3P27659 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms