Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc5P27641 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc5P27641 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc5P27641 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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