Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax3P24610 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms