Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pou3f1P21952 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms