Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcna1P16388 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcna1P16388 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms