Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms