Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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