Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mtnd1P03888 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mtnd1P03888 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms