Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms