Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms