Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms