Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc18a3O35304 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Slc18a3O35304 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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