Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5814J3QP80 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms