Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrp3E9Q1T6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrp3E9Q1T6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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