Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Phf11bB4XVQ1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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