Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud7bB2RUR8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms