Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms