Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprsB0V2N1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprsB0V2N1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms