Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms