Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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