Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
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