Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip6Q9Z1Y4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms