Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam50aQ9WV03 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms