Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms