Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BcamQ9R069 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcamQ9R069 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms