Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms