Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trpc5Q9QX29 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms