Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx5Q9JKQ4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms