Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms