Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms