Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms