Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms