Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms