Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl8cQ9D6I0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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