Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms