Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rfc5Q9D0F6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rfc5Q9D0F6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfc5Q9D0F6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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