Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf9Q9D0B0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf9Q9D0B0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms